枪械少女们可以独立作战，也可以变成枪械依附于人类进行作战，她们跟人类建立起了非常好的合作关系，并且人类也把枪械少女们当成是人类的一员。
玩家，作为残存人类当中的一员，跟枪械少女们并肩作战。
同时因为这些少女们的基因编码是用人类的基因来进行的，所以她们也会具备跟人类一模一样的情感，她们也会对食物对水有需求，同样也渴望爱情。
男主可以给她们带来爱情，这些少女们跟其他的人类女孩并无两样。
……
整个世界观在最开始是这样子的，而且小林洋介理解起来也没有什么问题，因为他在使用枪械少女们完成一个个不可能完成的任务，同时打入了机械城的内部。
可是随着支线和主线的交替进行，小林洋介慢慢觉得有些不太对劲。
在他杀死核炉守护者蒲川的时候，他跪在地上，脸上露出诡异的笑容。
蒲川是一个半人半机械的怪物，第一阶段人形态，第二阶段除了人的脑袋之外，其余的部分已经被机械化，机械展开在地面上，看起来就像是一只高脚蜘蛛。
打这里的时候，小林洋介至少死了上百次。
岂可修。
博米公司真的是对蜘蛛人有着极深的怨念吧？
怎么会弄出这么多的蜘蛛人出来？
不过，这都不重要了，重要的是小林洋介取得了胜利，成功击败了蒲川。
当他的头颅掉在地上的时候，他还没有完全丧失意识。
蒲川脸上露出诡异的笑容，问男主零，“真是愚蠢的人类，你能分清楚什么是真，什么是假吗？你觉得我是什么……？
而你……又……又……”
到这里，蒲川的嘴巴张开，已经失去了所有的生命。
与此同时，小林洋介看到，鲜血顺着蒲川的嘴角流了下来。
就是这一刻，小林洋介感觉头皮发麻。
蒲川你说的是什么呀？
可千万别吓我……
不知道为什么，小林洋介的心中充满了一种莫名的恐惧。
那是一种对于可能存在的真相的畏惧感。
小林洋介本能排斥那样的真相，所以才觉得可怕。
……
而在击杀了机械体研究室的哈奇博士的时候，小林洋介再一次得到了让他震惊的消息——
哈奇本来是一个看起来完全机械化的机械体，可是当他被小林洋介杀死的时候，脸上却露出了欣慰的表情。
哈奇倒在地上，身体当中火花四溅。
他的那张机械零件组成的脸上，居然能出现一抹诡异的笑容。
哈奇说，“我终于……解脱了。”
然后他用仅存的最后意识，看着男主角零，笑着说，“你拿回控制权了吗？你……指纹……密码……”
……
小林洋介抱着头，往后退开两步。
一些可怕的记忆碎片慢慢在大脑里面拼凑起来。
我的天呐，该不会是……
小林洋介的内心诞生了一个可怕的想法，但是他还没有得到验证。
……
花费了差不多30多个小时之后，小林洋介越来越没有信心和耐心继续去收集支线了，他想要去看看最后的真相究竟是什么。
于是一路打着主线，小林洋介终于带着枪械少女们，来到了最终一关——
机械之城的核心，主脑控制室当中。
在这里，他将直面机械王国的最高统治者，也就是机械之城的主脑。
打开控制室的阀门，解决掉了路上的杂兵，小林洋介一路坐着电梯来到了地下。
用男主的指纹开启总控室的大门时，小林洋介的心里面咯噔一下。
完了完了……
一切都向着他所能想到的最可怕的地方发展去了。
太可怕了，如果他的想法是真的话。
这个游戏藏着的真相，真的令人头皮发麻。
……
男主角一路下到最底层。
从电梯控制显示上来看，这里是-18层。
相当深入的一个位置。
距离地面大概有120多米。
在这里，他终于见到了最终BOSS——
一个跟他长得一模一样的人类。
不，准确来说，他只是外表上跟他一样罢了。
在他的身体上，插着无数根导管，一直连接着后方那个巨大的圆形天坑当中，类似于透明玻璃罩的东西里面。
在半球形的巨大玻璃罩当中，小林洋介看到了上面排布着的密密麻麻的电路。
……
那个装载玻璃罩当中，被保护起来的东西，才是真正的主脑。
而面前的这个跟男主长得一模一样的角色形象，只不过是被主脑控制的分身而已。
“你终于来了？”
主脑借用他的身份说，“不用害怕，这具身体只是你的复制人而已。”
他笑了笑，“多么精准的一个复制，是不是完全一模一样？”
男主角没有说话，只是静静地看着他。
这一段是用CG来进行表现的，为了不漏掉什么重要的剧情，所以小林洋介没有跳过。
“也许，是时候来告诉你真相了。”
主脑对着零笑了起来，“这仅仅是被虚拟出来的一个世界而已，人类，机械体……这些都不真实，包括你身边的那些枪械少女也是这样。”
“对，你是不是意识到了什么？”
主脑笑了起来，“你曾经创造了这里的一切，然后你又离开了这里，然后这个虚拟世界被无限地拓宽，变成了现在这个样子，只不过你重新回来了而已。
我已经等了你很久很久了……”
就在这时，主脑微微一笑，对着男主零说了两个字——
“主人。”
纳尼？！
小林洋介双手抓着头发，感觉头皮一阵发麻。
这究竟是一个什么样的展开？
……
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